More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1334 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  100 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  55.96 
 
 		 206 aa  224  6e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  55.96 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  50.75 
 
 		 209 aa  205  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  52.6 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  46.91 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  42.78 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  43.15 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  45.64 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  43 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  40.7 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  40.56 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  36.73 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  38.12 
 
 		 705 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  38.78 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  35.9 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  37.07 
 
 		 703 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  38.74 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  38.31 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  39.15 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 707 aa  104  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  33.17 
 
 		 234 aa  104  9e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  38.42 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  35.92 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  36.84 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  39.49 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  35.29 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  35.47 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  34.31 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  35.08 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  38.61 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 688 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  35 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  37.97 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  32.66 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  36.95 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  33.69 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  38.69 
 
 		 200 aa  97.8  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf161  thymidylate kinase  33.68 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.403235  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  36.67 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  34.72 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  33.5 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  37.43 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  35.32 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  36.76 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  35.18 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  34.34 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  35.64 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  32.86 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  35.5 
 
 		 211 aa  95.9  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  36.76 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  36.76 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  39.47 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  36.76 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  36.13 
 
 		 224 aa  95.5  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  35.41 
 
 		 217 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  32.99 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  38.17 
 
 		 225 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  36.23 
 
 		 218 aa  95.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  34.8 
 
 		 214 aa  94.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  33.67 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  36.51 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  34.33 
 
 		 219 aa  94.4  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  32.32 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  37.31 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  36.36 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  36 
 
 		 686 aa  94.4  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  35.12 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  37.02 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  35.79 
 
 		 901 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  38.02 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  34.5 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  36.23 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  36.36 
 
 		 206 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  35.29 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  35.83 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  35.5 
 
 		 206 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  33.68 
 
 		 216 aa  92  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  31.94 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  35.61 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  30.62 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  34 
 
 		 217 aa  92  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  34.33 
 
 		 281 aa  92  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  34.72 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>