More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5487 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  100 
 
 
270 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  100 
 
 
270 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  99.26 
 
 
270 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  79.18 
 
 
282 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  89.23 
 
 
268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  83.08 
 
 
248 aa  284  9e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  66.49 
 
 
272 aa  234  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  56.22 
 
 
302 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  71.13 
 
 
158 aa  192  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  67.79 
 
 
174 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  69.5 
 
 
169 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  68.84 
 
 
151 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 
166 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  53.9 
 
 
174 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  52.29 
 
 
182 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  60.45 
 
 
141 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  52.69 
 
 
206 aa  148  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  52.35 
 
 
158 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  50.61 
 
 
205 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 
219 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  49.46 
 
 
182 aa  139  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  47.52 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  46.04 
 
 
258 aa  130  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  49.65 
 
 
160 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 
142 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
149 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 
150 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
143 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
164 aa  95.5  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
172 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
147 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  41.91 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  37.61 
 
 
317 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
140 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
143 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  36.79 
 
 
305 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
311 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
311 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
311 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 
193 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
129 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  30 
 
 
208 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 
180 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
142 aa  59.3  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
229 aa  58.9  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
141 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
146 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
140 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
139 aa  57  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
144 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
143 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 
150 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
148 aa  56.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  34.86 
 
 
137 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  34.86 
 
 
137 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  34.86 
 
 
137 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
149 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
144 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  26.62 
 
 
149 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
299 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
138 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
137 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
145 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
136 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
144 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  30.36 
 
 
185 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  31.76 
 
 
161 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  33.94 
 
 
137 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  44.33 
 
 
142 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  31.76 
 
 
161 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  29.36 
 
 
156 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
166 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
137 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  38.89 
 
 
292 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
139 aa  53.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  38.71 
 
 
424 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
139 aa  53.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  32.48 
 
 
137 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  31.76 
 
 
149 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
155 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  33.1 
 
 
142 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  31.76 
 
 
149 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 
137 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  36.05 
 
 
137 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 
140 aa  52.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  28.23 
 
 
153 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
173 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
139 aa  52.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
146 aa  52.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  31.08 
 
 
149 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  31.08 
 
 
149 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>