166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4213 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  100 
 
 
342 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  42.39 
 
 
345 aa  269  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  40.43 
 
 
342 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.88 
 
 
629 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  42.86 
 
 
323 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  40.65 
 
 
336 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  35.69 
 
 
339 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  39.68 
 
 
361 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.28 
 
 
351 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  34.34 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  35.15 
 
 
333 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  38.41 
 
 
339 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  37.27 
 
 
358 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.97 
 
 
350 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  35.12 
 
 
346 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  35.1 
 
 
341 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.53 
 
 
337 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.74 
 
 
334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  40.68 
 
 
354 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.54 
 
 
333 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.94 
 
 
383 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  32.46 
 
 
312 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  33.77 
 
 
323 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.87 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  34.02 
 
 
335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  30.54 
 
 
353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.33 
 
 
330 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  29.12 
 
 
339 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
351 aa  99.8  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  28.22 
 
 
364 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  29.86 
 
 
350 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  32.79 
 
 
312 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  28.28 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  28.92 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  29.74 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  28.16 
 
 
358 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  30.45 
 
 
336 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  29.88 
 
 
364 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  30.31 
 
 
316 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  27.31 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  30.16 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  28.83 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  28.1 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  28.74 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  29.29 
 
 
361 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  31.36 
 
 
336 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
326 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  30 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  26.13 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  23.05 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  27.34 
 
 
330 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  22.97 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  27.05 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  28.88 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  28.29 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  29.96 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.77 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25.98 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.64 
 
 
339 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  29.29 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.63 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  24.3 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  27.57 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  26.61 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  24.34 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  26.33 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  26.33 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  30.16 
 
 
316 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  24.01 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  28.99 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  23.72 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  27.42 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 
367 aa  62.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  24.92 
 
 
421 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  24.33 
 
 
444 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  23.31 
 
 
433 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
398 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  26.27 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  21.73 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  24.39 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  22.91 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.25 
 
 
282 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
447 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
402 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  23.65 
 
 
378 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  26.85 
 
 
428 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
399 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  22.68 
 
 
437 aa  56.2  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
391 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  25 
 
 
431 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>