More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4175 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  62.21 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  62.21 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  62.21 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  57.41 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  58.17 
 
 		 263 aa  278  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  37.35 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0868  regulatory protein GntR, HTH  36.55 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2288  regulatory protein GntR HTH  41.7 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00127376  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1686  regulatory protein GntR HTH  42.99 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00156623  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  38.32 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1917  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000235972  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3218  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00133147  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  35.37 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1986  regulatory protein GntR, HTH  35.68 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  32.91 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4358  regulatory protein GntR, HTH  30.81 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.557304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  30.33 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  30.88 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  27.39 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  35.5 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  29 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.89 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3125  GntR domain-containing protein  35.03 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  24.32 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  24.32 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  29.51 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29.71 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  29.44 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  30 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  27.16 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  29.03 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  29.44 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  29.44 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  29.44 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  29.44 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  29.44 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  29.13 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  28.42 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  31.84 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  31.87 
 
 		 250 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  31.87 
 
 		 250 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  31.87 
 
 		 250 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  32.26 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  36.05 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  30.99 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  31.72 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  33.6 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  30.85 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  28.89 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  28.8 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  31.17 
 
 		 501 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  28.96 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  30.8 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  28.33 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.59 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.77 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  32.14 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  28.65 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  27.84 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.18 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  32.28 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31.11 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  29.84 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  23.39 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  28.02 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  28.42 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  25.84 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 490 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  29.79 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  37.09 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  32.88 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  29.44 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  32.88 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  32.88 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  25.34 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  32.88 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  32.88 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  32.88 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.21 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  31.97 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  27.01 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>