More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2994 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
317 aa  650    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 
1276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
602 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.31 
 
 
1694 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 
927 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 
543 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 
711 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  34.43 
 
 
560 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  33 
 
 
573 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
4079 aa  116  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
452 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
3035 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.56 
 
 
707 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
955 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.57 
 
 
730 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
4489 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.61 
 
 
623 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
1192 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  32.67 
 
 
576 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 
244 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
878 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
366 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.73 
 
 
810 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.76 
 
 
784 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.64 
 
 
836 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.03 
 
 
397 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1069 aa  99.8  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.22 
 
 
1056 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 
833 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
414 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  30.16 
 
 
648 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  30.88 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.02 
 
 
745 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
523 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
1094 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.08 
 
 
1138 aa  97.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
1276 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  30.23 
 
 
706 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  24.64 
 
 
635 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 
512 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
250 aa  96.3  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  29 
 
 
240 aa  95.9  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
3560 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.83 
 
 
988 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  30.35 
 
 
539 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
740 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  29.05 
 
 
391 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
363 aa  94  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.62 
 
 
818 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.85 
 
 
632 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
202 aa  94  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
649 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.04 
 
 
784 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
547 aa  92.8  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.34 
 
 
1013 aa  92.8  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 
314 aa  92.4  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.24 
 
 
1979 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.96 
 
 
1007 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.45 
 
 
267 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 
1121 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
409 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.43 
 
 
564 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.76 
 
 
1022 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
333 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
1827 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
465 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
329 aa  89.7  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  26.94 
 
 
417 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.25 
 
 
820 aa  89.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.96 
 
 
542 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.61 
 
 
373 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
594 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.05 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
716 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
409 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 
565 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
617 aa  87  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
637 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
740 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.9 
 
 
462 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.86 
 
 
1056 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
448 aa  86.3  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
662 aa  86.3  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.11 
 
 
706 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
265 aa  85.9  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 
331 aa  85.9  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
611 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
3172 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
635 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
713 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
635 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  28.48 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
375 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
732 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>