More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1643 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.62 
 
 		 766 aa  192  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.72 
 
 		 768 aa  184  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  53.33 
 
 		 511 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.76 
 
 		 862 aa  177  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  49.06 
 
 		 376 aa  174  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.94 
 
 		 1078 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 1301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  50.62 
 
 		 1113 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.38 
 
 		 1253 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  60.74 
 
 		 593 aa  170  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.57 
 
 		 1439 aa  169  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.09 
 
 		 769 aa  168  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.09 
 
 		 1039 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.38 
 
 		 608 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.28 
 
 		 500 aa  159  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.52 
 
 		 660 aa  158  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  50.94 
 
 		 849 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.69 
 
 		 771 aa  158  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.57 
 
 		 1426 aa  158  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  57.04 
 
 		 637 aa  157  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.38 
 
 		 544 aa  155  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.33 
 
 		 896 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  45.18 
 
 		 1265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.02 
 
 		 653 aa  153  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.54 
 
 		 813 aa  152  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  56.1 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.56 
 
 		 1032 aa  149  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 909 aa  149  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 		 603 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  49.65 
 
 		 440 aa  149  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.73 
 
 		 753 aa  149  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  48.08 
 
 		 812 aa  148  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  51.91 
 
 		 669 aa  148  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.68 
 
 		 603 aa  147  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  49.3 
 
 		 400 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  48.77 
 
 		 524 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  43.56 
 
 		 401 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.75 
 
 		 873 aa  145  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.23 
 
 		 644 aa  145  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 402 aa  145  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 1121 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  45.64 
 
 		 837 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.74 
 
 		 657 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.61 
 
 		 656 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.78 
 
 		 1111 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 931 aa  143  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.4 
 
 		 783 aa  142  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.32 
 
 		 781 aa  142  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 		 901 aa  141  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.2 
 
 		 984 aa  141  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  43.12 
 
 		 474 aa  140  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  56.03 
 
 		 550 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  43.4 
 
 		 458 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.55 
 
 		 530 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  46.04 
 
 		 559 aa  138  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.15 
 
 		 789 aa  136  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 1513 aa  135  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.69 
 
 		 886 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.79 
 
 		 763 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  46.5 
 
 		 268 aa  132  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 		 765 aa  131  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.79 
 
 		 720 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  42.38 
 
 		 477 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 2072 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 		 1276 aa  125  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 980 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  48.36 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.44 
 
 		 1325 aa  125  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2671  response regulator receiver domain-containing protein  43.12 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 737 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 1039 aa  122  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 		 472 aa  122  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  47.54 
 
 		 906 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  40.88 
 
 		 461 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 619 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 878 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 178 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 1425 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  43.17 
 
 		 483 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 764 aa  105  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 596 aa  104  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  42.24 
 
 		 127 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 758 aa  99.8  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 657 aa  98.2  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  38.69 
 
 		 479 aa  98.2  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  35.21 
 
 		 149 aa  95.5  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 1045 aa  91.7  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2267  putative PAS/PAC sensor protein  34.23 
 
 		 576 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0262742  normal  0.128517 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  35.92 
 
 		 632 aa  87.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.05 
 
 		 700 aa  84.7  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 921 aa  84.3  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1697  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.359972 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  33.59 
 
 		 455 aa  81.3  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.9 
 
 		 712 aa  80.1  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 759 aa  79.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2037  response regulator receiver domain-containing protein  32.85 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.119709  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2673  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>