89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5512 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5512  hypothetical protein  100 
 
 		 918 aa  1882    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104688  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2249  hypothetical protein  88.42 
 
 		 916 aa  1669    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1017 aa  148  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  25.22 
 
 		 1324 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  32.16 
 
 		 675 aa  75.1  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  27.93 
 
 		 1000 aa  73.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  22.84 
 
 		 1500 aa  73.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  28.4 
 
 		 992 aa  73.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  24.1 
 
 		 1261 aa  71.2  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  20.48 
 
 		 1550 aa  68.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  26.79 
 
 		 1309 aa  68.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  24.15 
 
 		 1314 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  27.04 
 
 		 934 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  27.68 
 
 		 859 aa  67  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  25.29 
 
 		 843 aa  66.6  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1523 aa  66.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  24.23 
 
 		 845 aa  65.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 		 1056 aa  65.1  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  26.01 
 
 		 897 aa  64.7  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  30.18 
 
 		 801 aa  64.7  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  25.12 
 
 		 838 aa  64.3  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  33.7 
 
 		 1138 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  30.1 
 
 		 1311 aa  63.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  28.77 
 
 		 1509 aa  63.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  26.94 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  31.4 
 
 		 713 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 785 aa  59.3  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  27.07 
 
 		 1326 aa  59.7  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  20.89 
 
 		 2145 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  28.24 
 
 		 900 aa  58.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 911 aa  58.2  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 814 aa  57.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  23.68 
 
 		 2413 aa  57.8  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  23.19 
 
 		 822 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  23 
 
 		 392 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1666  transcriptional regulator, XRE family  27.84 
 
 		 462 aa  55.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1088 aa  55.1  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 671 aa  55.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  24.73 
 
 		 1044 aa  54.7  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  29.6 
 
 		 1108 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1068 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 654 aa  52.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  23.39 
 
 		 849 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  26.6 
 
 		 992 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 640 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  25.65 
 
 		 899 aa  51.6  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  24.86 
 
 		 680 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1383 aa  51.2  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  27.05 
 
 		 775 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1404 aa  50.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  23.14 
 
 		 1185 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  27.89 
 
 		 1024 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  26.51 
 
 		 958 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  30.2 
 
 		 680 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  28.1 
 
 		 964 aa  49.7  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  23.83 
 
 		 385 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  26.96 
 
 		 1125 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 652 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 857 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  28.77 
 
 		 715 aa  49.3  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  27.53 
 
 		 965 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  29.79 
 
 		 775 aa  48.9  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  25.21 
 
 		 983 aa  48.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  28.92 
 
 		 908 aa  48.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  28.98 
 
 		 666 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  25.44 
 
 		 915 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  25.43 
 
 		 783 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1234  Tetratricopeptide TPR_4  27.75 
 
 		 832 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840453  decreased coverage  0.00091605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1345  HPr kinase  22.62 
 
 		 473 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  24.58 
 
 		 995 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 1048 aa  46.2  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  25.08 
 
 		 829 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  28.02 
 
 		 992 aa  45.8  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  30.34 
 
 		 1033 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 953 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  26.92 
 
 		 788 aa  45.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  24.31 
 
 		 1014 aa  45.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  29.33 
 
 		 806 aa  45.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1105 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  17.97 
 
 		 1039 aa  45.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  25.25 
 
 		 919 aa  45.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  27.7 
 
 		 1003 aa  45.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  31.94 
 
 		 1427 aa  45.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  26.46 
 
 		 990 aa  45.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 924 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  26.49 
 
 		 790 aa  44.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 		 896 aa  44.7  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  24.04 
 
 		 1030 aa  44.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  26.46 
 
 		 1228 aa  44.3  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>