186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4745 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4745  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 230 aa  454  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0493146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3590  putative GAF sensor protein  49.12 
 
 		 231 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3585  putative GAF sensor protein  49.12 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555714  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3658  putative GAF sensor protein  49.12 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2036  putative GAF sensor protein  38.79 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5263  putative GAF sensor protein  39.3 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4311  putative GAF sensor protein  38.14 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1493  putative GAF sensor protein  47.06 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 312 aa  95.9  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 441 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  36.18 
 
 		 364 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 441 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 1171 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.59 
 
 		 576 aa  79  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 579 aa  76.3  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  31.58 
 
 		 595 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.82 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  31.82 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 680 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.87 
 
 		 781 aa  69.7  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 681 aa  68.6  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.94 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  28.29 
 
 		 732 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 		 1125 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.34 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.34 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2895  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939958  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4177  hypothetical protein  28.38 
 
 		 344 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.878015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2328  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  29.53 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  29.73 
 
 		 1125 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  29.53 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4113  diguanylate cyclase  34.4 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  27.52 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  27.52 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  26.11 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  27.52 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  29.17 
 
 		 794 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  33.98 
 
 		 866 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0329  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.41 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.832493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1974  diguanylate cyclase  29.41 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.25 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  27.03 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.87 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2748  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.79 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  28.48 
 
 		 782 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3803  diguanylate cyclase  30.26 
 
 		 489 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0126112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 1203 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  26.03 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0219  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  30.26 
 
 		 489 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2059  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.95 
 
 		 718 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0475762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  26.67 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2267  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0108452  hitchhiker  0.000000348318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0966  diguanylate cyclase  26.97 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  26.03 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  27.89 
 
 		 431 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1566  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.57 
 
 		 483 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.95 
 
 		 531 aa  55.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.86 
 
 		 506 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  28.57 
 
 		 441 aa  55.5  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 1120 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1600  GGDEF family protein  28.57 
 
 		 594 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  24.31 
 
 		 1179 aa  55.5  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  26.03 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  25.69 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2586  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  27.15 
 
 		 592 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  29.41 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 878 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  26.71 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  26.35 
 
 		 669 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.97 
 
 		 1309 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2286  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  26.35 
 
 		 592 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128359  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 620 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  26.71 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  26.35 
 
 		 323 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  26 
 
 		 323 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.34 
 
 		 722 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 837 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  26 
 
 		 323 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.73 
 
 		 319 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.48 
 
 		 318 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  24.32 
 
 		 324 aa  52.4  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 		 321 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  25.68 
 
 		 323 aa  52.4  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.68 
 
 		 1423 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  26.83 
 
 		 879 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 929 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08056  hypothetical protein  26.14 
 
 		 407 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2829  GAF domain-containing protein  30 
 
 		 393 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  27.89 
 
 		 316 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  26.58 
 
 		 801 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  26.62 
 
 		 406 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.03 
 
 		 740 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3804  EAL domain-containing protein  28.28 
 
 		 598 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4958  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 		 517 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0510  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  28.24 
 
 		 1121 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.68 
 
 		 322 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 		 513 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0964  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 		 513 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>