More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2258 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  64.17 
 
 		 591 aa  720    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  67.81 
 
 		 555 aa  784    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  67.81 
 
 		 555 aa  784    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  86.55 
 
 		 550 aa  1000    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 558 aa  1133    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  67.81 
 
 		 554 aa  780    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  40.76 
 
 		 570 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  40.56 
 
 		 578 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  38.05 
 
 		 567 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  36.22 
 
 		 566 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  37.74 
 
 		 567 aa  333  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  36.51 
 
 		 568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  33.88 
 
 		 551 aa  280  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  33.21 
 
 		 576 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.37 
 
 		 579 aa  270  7e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  31.43 
 
 		 565 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 580 aa  202  9e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 581 aa  182  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 592 aa  180  4.999999999999999e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 		 590 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 563 aa  163  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 597 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 569 aa  158  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.66 
 
 		 586 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 		 600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  25.79 
 
 		 606 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  24.56 
 
 		 619 aa  123  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 592 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  23.24 
 
 		 585 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  23.91 
 
 		 604 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 		 606 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.37 
 
 		 622 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  25.28 
 
 		 567 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.89 
 
 		 581 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 		 603 aa  97.8  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 		 592 aa  97.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.31 
 
 		 546 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 		 566 aa  94  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 524 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 619 aa  91.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 512 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  21.73 
 
 		 525 aa  88.6  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 564 aa  87.4  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 522 aa  87.4  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 		 614 aa  87  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  24.05 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 		 617 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  21.35 
 
 		 525 aa  85.1  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 611 aa  85.1  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 551 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 639 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.37 
 
 		 575 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 508 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.12 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 575 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  22.93 
 
 		 575 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  21.18 
 
 		 525 aa  80.9  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  22.93 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 544 aa  80.5  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 599 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  22.41 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.76 
 
 		 534 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 544 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  26.07 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 527 aa  79.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 604 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 608 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.71 
 
 		 538 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  26.84 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D17  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  25.76 
 
 		 600 aa  78.2  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.84 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  22.99 
 
 		 622 aa  77.8  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 512 aa  77.4  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 546 aa  77.4  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  24.5 
 
 		 622 aa  77  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  23.48 
 
 		 520 aa  76.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  24.17 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  22.51 
 
 		 575 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 		 556 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.15 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  21.93 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.49 
 
 		 530 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  23.71 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2749  extracellular solute-binding protein family 5  24.13 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.954537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  20.8 
 
 		 527 aa  75.1  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1036  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 524 aa  75.1  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.23 
 
 		 524 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>