More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1253 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  44.12 
 
 		 822 aa  672    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 778 aa  1596    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  42.84 
 
 		 769 aa  615  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  41.6 
 
 		 741 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  41.94 
 
 		 777 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  41.88 
 
 		 777 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  41.53 
 
 		 788 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  41.88 
 
 		 777 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  40.05 
 
 		 801 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  37.99 
 
 		 741 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 873 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 		 779 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 873 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 781 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  34.22 
 
 		 773 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  35.47 
 
 		 787 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 770 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 813 aa  422  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  31.36 
 
 		 935 aa  415  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 824 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 839 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 841 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  34.47 
 
 		 772 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 839 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  31.9 
 
 		 797 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 760 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 775 aa  363  8e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 802 aa  363  8e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 825 aa  350  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 825 aa  350  7e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 848 aa  348  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 826 aa  347  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 821 aa  347  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 825 aa  337  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 856 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 805 aa  332  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 868 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 807 aa  324  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 821 aa  323  8e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  43.05 
 
 		 1188 aa  252  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  47.47 
 
 		 317 aa  191  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  25.91 
 
 		 775 aa  153  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 715 aa  111  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 720 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 688 aa  100  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.52 
 
 		 712 aa  100  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 757 aa  96.3  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 728 aa  92.8  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 		 742 aa  90.1  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 705 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 681 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 782 aa  84.3  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  23.39 
 
 		 743 aa  82.4  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  22.67 
 
 		 727 aa  82  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 697 aa  80.5  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  26.81 
 
 		 706 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  26.51 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  26.51 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  26.51 
 
 		 721 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  26.51 
 
 		 706 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  26.13 
 
 		 700 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  26.13 
 
 		 700 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 700 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 700 aa  77  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 700 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 700 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 700 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 700 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 736 aa  75.1  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 742 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 701 aa  74.7  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 706 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  25.84 
 
 		 710 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 705 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 700 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 731 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  22.88 
 
 		 861 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 702 aa  72  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 723 aa  71.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 694 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 709 aa  71.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  20.53 
 
 		 652 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  22 
 
 		 706 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  22.31 
 
 		 634 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 656 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 800 aa  68.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 702 aa  68.2  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.68 
 
 		 862 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 726 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 737 aa  67.4  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 727 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.99 
 
 		 862 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  21.32 
 
 		 828 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  29.14 
 
 		 764 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.82 
 
 		 759 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  21.53 
 
 		 828 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  21.14 
 
 		 653 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>