More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl314 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  100 
 
 		 905 aa  1810    Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  30.37 
 
 		 1043 aa  366  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  32.48 
 
 		 1055 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  32.48 
 
 		 1055 aa  363  6e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  33.13 
 
 		 1052 aa  362  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  32.27 
 
 		 1055 aa  360  6e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  35.87 
 
 		 1017 aa  356  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  32.45 
 
 		 1033 aa  353  8.999999999999999e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  31.82 
 
 		 982 aa  353  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 1029 aa  350  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  33.55 
 
 		 1051 aa  348  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  31.8 
 
 		 1061 aa  348  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  28.04 
 
 		 1062 aa  343  9e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  32.21 
 
 		 1041 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  33.65 
 
 		 1063 aa  337  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  31.64 
 
 		 1051 aa  336  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  31.34 
 
 		 1028 aa  334  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  27.02 
 
 		 1058 aa  333  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  31.27 
 
 		 1042 aa  327  8.000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  32.46 
 
 		 1042 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  30.56 
 
 		 1035 aa  318  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.39 
 
 		 1031 aa  316  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  27.75 
 
 		 1066 aa  308  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  30.29 
 
 		 1033 aa  303  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  32.79 
 
 		 1065 aa  303  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  25.93 
 
 		 1033 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  32.05 
 
 		 1053 aa  300  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  32.21 
 
 		 946 aa  282  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  30.71 
 
 		 993 aa  272  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  31.61 
 
 		 953 aa  267  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  31.61 
 
 		 953 aa  267  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  32.69 
 
 		 952 aa  266  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  32.01 
 
 		 1149 aa  265  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.43 
 
 		 974 aa  265  4e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  31.33 
 
 		 979 aa  263  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  28.73 
 
 		 949 aa  255  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  28.85 
 
 		 1287 aa  253  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  30.52 
 
 		 813 aa  250  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  28.18 
 
 		 1418 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  28.36 
 
 		 812 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  29.89 
 
 		 949 aa  246  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  28.92 
 
 		 848 aa  244  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.93 
 
 		 979 aa  243  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  26.45 
 
 		 1348 aa  237  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  28.76 
 
 		 815 aa  234  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  29.54 
 
 		 967 aa  233  8.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  29.87 
 
 		 987 aa  233  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  28.4 
 
 		 980 aa  233  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  27.37 
 
 		 938 aa  231  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  27.53 
 
 		 1077 aa  227  9e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  27.11 
 
 		 928 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  27.11 
 
 		 956 aa  224  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  34.57 
 
 		 773 aa  200  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  33 
 
 		 967 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  30.14 
 
 		 469 aa  152  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  29.89 
 
 		 475 aa  150  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  29.32 
 
 		 536 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  29.74 
 
 		 385 aa  140  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  29.1 
 
 		 556 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  28.87 
 
 		 558 aa  138  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  28.92 
 
 		 524 aa  138  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  28.09 
 
 		 462 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  26.35 
 
 		 459 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  28.69 
 
 		 606 aa  128  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  28.11 
 
 		 607 aa  127  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  27.99 
 
 		 643 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  28.95 
 
 		 560 aa  122  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  28.65 
 
 		 560 aa  122  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  27.96 
 
 		 560 aa  120  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  28.39 
 
 		 560 aa  120  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  27.52 
 
 		 581 aa  121  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  26.39 
 
 		 560 aa  120  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  27.01 
 
 		 629 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  28.39 
 
 		 398 aa  120  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  27.86 
 
 		 706 aa  118  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  27.66 
 
 		 560 aa  117  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  27.73 
 
 		 545 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  26.97 
 
 		 545 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  26.96 
 
 		 802 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  25.61 
 
 		 613 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.65 
 
 		 804 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  26.12 
 
 		 545 aa  111  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  27.25 
 
 		 776 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  27.51 
 
 		 583 aa  110  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  25.13 
 
 		 550 aa  110  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  25.36 
 
 		 657 aa  108  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  27.09 
 
 		 585 aa  108  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  27.09 
 
 		 585 aa  108  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  27.09 
 
 		 585 aa  107  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  27.49 
 
 		 586 aa  107  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  26.5 
 
 		 583 aa  107  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.51 
 
 		 783 aa  107  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  27.23 
 
 		 586 aa  105  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  27.23 
 
 		 586 aa  105  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  27.23 
 
 		 586 aa  105  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  25.64 
 
 		 585 aa  105  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  27.68 
 
 		 586 aa  105  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  26.77 
 
 		 586 aa  104  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  27.95 
 
 		 797 aa  104  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  26.77 
 
 		 586 aa  104  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>