147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4171 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  100 
 
 		 406 aa  797    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  67.81 
 
 		 403 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  66.5 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  62.68 
 
 		 410 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  48.12 
 
 		 445 aa  263  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  40.81 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  39.13 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  38.91 
 
 		 363 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  42.21 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  41.94 
 
 		 459 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  41.71 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  39.9 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  41.4 
 
 		 459 aa  146  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  40.32 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  40.87 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  35.68 
 
 		 380 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  35.78 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  38.73 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  39.6 
 
 		 381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  31.44 
 
 		 372 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  29.37 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  29.28 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  35.98 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  37.11 
 
 		 437 aa  133  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  32.38 
 
 		 459 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  31.07 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  34.65 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  31.97 
 
 		 466 aa  126  7e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  37.5 
 
 		 433 aa  125  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  35.32 
 
 		 450 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  36.84 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  34.9 
 
 		 437 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  35.75 
 
 		 430 aa  123  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  36.65 
 
 		 445 aa  123  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  35.98 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  35.98 
 
 		 473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  35.98 
 
 		 473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  34.2 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  31.75 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  38.67 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  39.89 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  33.51 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  33.45 
 
 		 386 aa  120  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  33.65 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  33.84 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  34.4 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  34.38 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  35.29 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  37.66 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  36.49 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  36.41 
 
 		 430 aa  116  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  35.08 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  34.69 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  32.31 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  34.25 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  35.08 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  29.6 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  36.14 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  33.94 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  31.79 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  33.51 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  36.49 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  33.81 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  35.21 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  36.36 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  37.43 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  32.38 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  28.62 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  37.43 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  29.15 
 
 		 417 aa  109  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  31.96 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  36.9 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  32.49 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  36.22 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  33.51 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  35.56 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  36.32 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  35.52 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  33.68 
 
 		 428 aa  106  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0006  type IV secretion system protein VirB10  34.3 
 
 		 486 aa  106  7e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.44093  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  36.32 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  35.98 
 
 		 373 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  34.95 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  34.41 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  33.87 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  32.26 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  37.7 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  34.67 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  38.8 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  36.61 
 
 		 421 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  34.41 
 
 		 424 aa  103  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  36.51 
 
 		 375 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  31.43 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  29.54 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  31.43 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  31.43 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  34.39 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  35.42 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  34.95 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>