More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3933 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 579 aa  1163    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 572 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 550 aa  273  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 550 aa  266  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 577 aa  176  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  26.43 
 
 		 561 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  38.83 
 
 		 1160 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  38.61 
 
 		 460 aa  137  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.39 
 
 		 1190 aa  136  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 512 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  35.68 
 
 		 1092 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  25.8 
 
 		 505 aa  130  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 583 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 631 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 		 1362 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 867 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 934 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 850 aa  126  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  34.4 
 
 		 930 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  34.03 
 
 		 847 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 930 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  33.61 
 
 		 847 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  33.65 
 
 		 583 aa  125  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 583 aa  125  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 840 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 725 aa  124  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 907 aa  123  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  32.07 
 
 		 364 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 662 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 759 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.82 
 
 		 1063 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.45 
 
 		 1061 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.62 
 
 		 847 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 586 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  35.35 
 
 		 488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  32.64 
 
 		 326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.07 
 
 		 1167 aa  120  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 713 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 571 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 336 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 344 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.63 
 
 		 844 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 575 aa  118  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 336 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.53 
 
 		 820 aa  116  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  36.14 
 
 		 1045 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  34.42 
 
 		 872 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 		 755 aa  115  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 465 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 489 aa  114  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  32.23 
 
 		 692 aa  114  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0249  sensor histidine kinase  32 
 
 		 342 aa  113  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 635 aa  113  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 738 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 717 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 602 aa  113  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.41 
 
 		 1163 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 929 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.07 
 
 		 1168 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 901 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 339 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  36.76 
 
 		 500 aa  112  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 1124 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 713 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  26.8 
 
 		 717 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 655 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  37.24 
 
 		 655 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 1132 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 347 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 571 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 873 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 372 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5999  two component sensor kinase  32.63 
 
 		 331 aa  110  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 500 aa  110  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 655 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 620 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 446 aa  109  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 258 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  35.78 
 
 		 620 aa  109  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  38.27 
 
 		 1132 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  33.33 
 
 		 334 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 507 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 352 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  31.96 
 
 		 856 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 489 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 455 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  33 
 
 		 1027 aa  107  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 499 aa  107  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 588 aa  107  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>