More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2488 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2488  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5055  transcriptional regulator AraC family  34.47 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4803  transcriptional regulator, AraC family  31.14 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.413232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  50.42 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7106  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509238  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4892  transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  0.621301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3495  AraC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1908  transcriptional regulator PobR  48.45 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3499  helix-turn-helix, AraC type  46.6 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  40 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  35.91 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0972  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  35.4 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 319 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2728  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0297  AraC family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  44.9 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7085  transcriptional regulator, AraC family  46.3 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.425365  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  40.18 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10660  putative transcriptional regulator  34.87 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.967663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  42.57 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2435  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.996011  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6221  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04223  HpaA  41.41 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04189  hypothetical protein  41.41 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3709  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.680131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4577  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  41.41 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1203  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  41 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.375104 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1183  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  41 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1218  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  41 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.398586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1067  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  41 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1172  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  41 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0890  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.16 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3376  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1539  transcriptional regulator, AraC family  44.32 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0619786  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1949  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0706  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0633  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1416  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2466  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  32.84 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4132  transcriptional regulator, AraC family  30.54 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2462  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529684  hitchhiker  0.000432103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0873  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4477  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  27.98 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4619  transcriptional regulator, AraC family  25.96 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3096  helix-turn-helix domain-containing protein  23.13 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5549  transcriptional regulator, AraC family  37.17 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  26 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3892  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1389  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3797  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00910315  normal  0.099485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0470  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  31.85 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2298  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000152227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0640  pobR protein  36.73 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6702  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5741  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1751  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2771  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2574  helix-turn-helix domain-containing protein  38.18 
 
 		 343 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0769  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636487  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4042  transcriptional regulator, AraC family  22.52 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.600459  normal  0.0950634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4428  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>