More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1834 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
397 aa  796    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  61.29 
 
 
392 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0562  polysaccharide deacetylase  49.5 
 
 
236 aa  156  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 
425 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 
409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 
243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
503 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 
387 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 
247 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
352 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  34.86 
 
 
373 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 
255 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 
244 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 
324 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 
542 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.81 
 
 
468 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  36.21 
 
 
520 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  28.96 
 
 
417 aa  99  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 
291 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  33.33 
 
 
234 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 
465 aa  96.3  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 
344 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 
234 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  30.54 
 
 
264 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 
204 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  38.16 
 
 
250 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 
234 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  34.22 
 
 
287 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 
256 aa  94  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
219 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 
242 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  36.71 
 
 
199 aa  92.8  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 
234 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 
234 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 
234 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  31.15 
 
 
234 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  28.51 
 
 
258 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 
305 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 
327 aa  92.8  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 
234 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 
240 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 
234 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 
243 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  30.6 
 
 
234 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  32.42 
 
 
488 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 
258 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  30.59 
 
 
244 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
479 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 
204 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
227 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
307 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
208 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  30.81 
 
 
481 aa  90.9  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
232 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 
262 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
267 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.82 
 
 
573 aa  90.1  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  32.04 
 
 
479 aa  89.7  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
233 aa  89.7  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 
263 aa  89.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
273 aa  89.7  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  34.63 
 
 
268 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
522 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
280 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 
372 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  37.11 
 
 
280 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 
258 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
537 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.95 
 
 
256 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 
345 aa  87  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
248 aa  87  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 
240 aa  86.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 
273 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 
235 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 
1154 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 
275 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 
263 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  29.9 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.65 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  28.35 
 
 
236 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.76 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  32.97 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>