More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0347 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0347  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  100 
 
 
366 aa  738    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  77.65 
 
 
355 aa  556  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1391  acetyl-lysine deacetylase  53.01 
 
 
358 aa  355  6.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.971431  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3459  acetyl-lysine deacetylase  51.44 
 
 
352 aa  306  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2723  acetyl-lysine deacetylase  49.43 
 
 
366 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2180  acetyl-lysine deacetylase  44 
 
 
348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.749889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0317  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  42.74 
 
 
348 aa  255  7e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3310  acetyl-lysine deacetylase  39.71 
 
 
351 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0776  acetyl-lysine deacetylase  35.75 
 
 
351 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6288  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  39.66 
 
 
361 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1498  acetyl-lysine deacetylase  36.54 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2612  acetyl-lysine deacetylase  34 
 
 
387 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.880671  normal  0.701984 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0324  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  32.87 
 
 
356 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.13 
 
 
375 aa  160  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1757  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  32.78 
 
 
383 aa  146  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0451  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  32.4 
 
 
346 aa  143  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.95 
 
 
349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.61 
 
 
338 aa  123  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.81 
 
 
335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.798793 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1139  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.3 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0335688  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0170  acetyl-lysine deacetylase  31.27 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000443828  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.1 
 
 
335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1259  acetylornithine deacetylase / N2-acetyl-L-lysine deacetylase  30.64 
 
 
335 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  24.87 
 
 
401 aa  86.7  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.03 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1729  peptidase  23.39 
 
 
400 aa  77  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3178  peptidase M20  27.01 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.93 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  23.62 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  24.44 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.9 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3197  peptidase  24.45 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.92 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.04 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.62 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02705  hypothetical protein  24.18 
 
 
403 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0820  M20/DapE family protein YgeY  24.18 
 
 
403 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3005  peptidase  24.18 
 
 
403 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3032  peptidase  24.18 
 
 
403 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02667  hypothetical protein  24.18 
 
 
402 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  27.22 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  30.2 
 
 
460 aa  67  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4162  peptidase  24.18 
 
 
403 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.52 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0836  peptidase  24.18 
 
 
403 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  26.15 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.56 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  24.87 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  25.26 
 
 
381 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.43 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.88 
 
 
353 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  25.97 
 
 
395 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1432  peptidase  29.19 
 
 
445 aa  63.5  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.02 
 
 
358 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  28.46 
 
 
388 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1085  peptidase M20  25.72 
 
 
403 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000939958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.21 
 
 
354 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  25.28 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.84 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  26.76 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.39 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  25.43 
 
 
416 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.07 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  23.59 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  24.87 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  23.12 
 
 
394 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3165  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.27 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.608359 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  25.79 
 
 
383 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.46 
 
 
405 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  25.36 
 
 
412 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.3 
 
 
354 aa  59.7  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.32 
 
 
392 aa  59.7  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.34 
 
 
397 aa  59.7  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2019  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.91 
 
 
377 aa  59.7  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  25.89 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  30.23 
 
 
443 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0275  acetylornithine deacetylase  25.65 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  27.72 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.2 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.97 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.12 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  23.18 
 
 
354 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.88 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.45 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.3 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  23.57 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  21.76 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  25.81 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.65 
 
 
383 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  28.65 
 
 
383 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  27.88 
 
 
436 aa  57.4  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>