150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1076 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  100 
 
 		 437 aa  895    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  66.06 
 
 		 447 aa  615  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  65.22 
 
 		 449 aa  609  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  63.16 
 
 		 446 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  62.77 
 
 		 436 aa  551  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  38.39 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  36.76 
 
 		 450 aa  239  5e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  34.77 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  28.57 
 
 		 1293 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  26.97 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  30.79 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  29.6 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  26.85 
 
 		 428 aa  162  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  25.79 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  28.6 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  27.64 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  28.47 
 
 		 454 aa  150  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  27.29 
 
 		 511 aa  143  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  28.54 
 
 		 500 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  29.82 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  29.22 
 
 		 500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  25.28 
 
 		 496 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  28.35 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  27.41 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  30.06 
 
 		 532 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  25.28 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  27.43 
 
 		 524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  27.99 
 
 		 512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  29.8 
 
 		 538 aa  126  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  28.98 
 
 		 520 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  25.44 
 
 		 480 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  26.27 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  26.27 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  24.62 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  24.62 
 
 		 427 aa  114  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.45 
 
 		 722 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  26.01 
 
 		 498 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  26.77 
 
 		 516 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  25.54 
 
 		 494 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  27.96 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  27.96 
 
 		 463 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  27.96 
 
 		 463 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.23 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  25.93 
 
 		 436 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  25.33 
 
 		 465 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  26.01 
 
 		 431 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 		 539 aa  86.7  7e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  22.66 
 
 		 537 aa  86.7  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  22.11 
 
 		 549 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  24.1 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.39 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  23.58 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.92 
 
 		 1033 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  23.67 
 
 		 489 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  22.81 
 
 		 538 aa  63.9  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  22.76 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  28.74 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  27.98 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  25.57 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  30.06 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  37.33 
 
 		 502 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  37.33 
 
 		 502 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  48.08 
 
 		 468 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  24.2 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  46.15 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1495  hypothetical protein  44.26 
 
 		 485 aa  51.6  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  21.45 
 
 		 476 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  44.44 
 
 		 491 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  46 
 
 		 505 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.61 
 
 		 369 aa  50.4  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  44.23 
 
 		 468 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  23.28 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  27.33 
 
 		 365 aa  50.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  46 
 
 		 501 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  22.39 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  24.13 
 
 		 460 aa  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  46 
 
 		 503 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  50 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  33.05 
 
 		 566 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  25.76 
 
 		 372 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  21.63 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  26.19 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  26.21 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  40.82 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  29.75 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  23.13 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  23.13 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  22.19 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  23.13 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  48 
 
 		 522 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  50 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  23.13 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  46 
 
 		 508 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  23.04 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  25.86 
 
 		 467 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  22.22 
 
 		 445 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  21.41 
 
 		 436 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  47.92 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>