150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0476 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0476  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 390 aa  759    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  25.62 
 
 		 487 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 		 1656 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0794  WD-40 repeat-containing protein  29.79 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1789 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.71 
 
 		 1481 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1854  WD-40 repeat-containing protein  29.73 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.417147  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0342  Pyrrolo-quinoline quinone  27.56 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.333089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  29 
 
 		 1523 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.63 
 
 		 1164 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.79 
 
 		 1240 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1714 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1510 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  27.13 
 
 		 1552 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  29.48 
 
 		 1454 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.15 
 
 		 1399 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 		 1711 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.58 
 
 		 1348 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1176 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1553 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.74 
 
 		 1760 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.28 
 
 		 1364 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.81 
 
 		 608 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.75 
 
 		 664 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.31 
 
 		 1661 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.07 
 
 		 1163 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.33 
 
 		 1557 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1304 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  28.88 
 
 		 1599 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.75 
 
 		 1242 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.81 
 
 		 1161 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2118  WD-40 repeat protein  24.92 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  20.41 
 
 		 1161 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.15 
 
 		 1236 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.15 
 
 		 1686 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.96 
 
 		 1868 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  24.04 
 
 		 1229 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  29.67 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  26.37 
 
 		 1477 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  28.06 
 
 		 1280 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  29.05 
 
 		 1100 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  29.74 
 
 		 1211 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 		 687 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.41 
 
 		 1190 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.15 
 
 		 630 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.2 
 
 		 698 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.85 
 
 		 1363 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1858 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.2 
 
 		 1766 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.45 
 
 		 919 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  27.33 
 
 		 464 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25 
 
 		 1262 aa  57  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  26.74 
 
 		 1334 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  27.64 
 
 		 696 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  23.7 
 
 		 1373 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  24.92 
 
 		 608 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  24.16 
 
 		 1016 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.76 
 
 		 1267 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.64 
 
 		 947 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  26.24 
 
 		 1443 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  25.79 
 
 		 774 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.09 
 
 		 1247 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  23.83 
 
 		 1016 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.4 
 
 		 676 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0378  hypothetical protein  21.84 
 
 		 440 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0579188  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.35 
 
 		 930 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  24.48 
 
 		 574 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  25.68 
 
 		 778 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  24.18 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  25.53 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  22.07 
 
 		 783 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.6 
 
 		 1609 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.02 
 
 		 1652 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.14 
 
 		 1004 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  27.51 
 
 		 1330 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  25.25 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  23.69 
 
 		 589 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.32 
 
 		 596 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  21.12 
 
 		 322 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.72 
 
 		 657 aa  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.91 
 
 		 692 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  21.75 
 
 		 564 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 		 733 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  25.23 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.25 
 
 		 1217 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  23.08 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01387  meiotic recombination protein Ski8/Rec14, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08860)  28.49 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  30.37 
 
 		 742 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 1221 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  25.23 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  21.58 
 
 		 1188 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.62 
 
 		 1357 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1209 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.57 
 
 		 1411 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.67 
 
 		 1607 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.15 
 
 		 1209 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.81 
 
 		 1213 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  21.99 
 
 		 1177 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1807 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.58 
 
 		 1072 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>