56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2354 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  51.42 
 
 		 641 aa  661    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  58.33 
 
 		 644 aa  758    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  100 
 
 		 652 aa  1319    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  36.46 
 
 		 647 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  33.44 
 
 		 716 aa  355  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  35.51 
 
 		 715 aa  332  2e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  30.48 
 
 		 625 aa  300  5e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  31.64 
 
 		 807 aa  295  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  30.23 
 
 		 660 aa  291  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  34.45 
 
 		 536 aa  287  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  31.93 
 
 		 802 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  29.12 
 
 		 684 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  28.28 
 
 		 601 aa  247  4e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  27.54 
 
 		 697 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 610 aa  240  5.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 679 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 678 aa  238  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  28.38 
 
 		 680 aa  223  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 625 aa  221  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  34.52 
 
 		 349 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  32.95 
 
 		 349 aa  169  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  32.89 
 
 		 328 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 329 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  37.26 
 
 		 306 aa  146  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  40.1 
 
 		 224 aa  144  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  39.61 
 
 		 307 aa  141  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  33.9 
 
 		 296 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  28.67 
 
 		 290 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  34.03 
 
 		 332 aa  111  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  21.11 
 
 		 604 aa  88.2  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  23.67 
 
 		 295 aa  72  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  24.89 
 
 		 300 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  29 
 
 		 284 aa  63.5  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  20.4 
 
 		 615 aa  62  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.219631 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  26.07 
 
 		 658 aa  60.5  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  22.98 
 
 		 590 aa  56.6  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0423  hypothetical protein  23.92 
 
 		 307 aa  55.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1343  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 256 aa  53.9  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.753846 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  24.11 
 
 		 574 aa  53.5  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  26.23 
 
 		 558 aa  53.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  22.75 
 
 		 581 aa  51.6  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  25 
 
 		 558 aa  51.2  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  23.35 
 
 		 582 aa  50.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  23.13 
 
 		 273 aa  48.5  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  22.34 
 
 		 578 aa  47.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  25 
 
 		 558 aa  47.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  22.05 
 
 		 554 aa  48.1  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  24.26 
 
 		 558 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  22.54 
 
 		 558 aa  47  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 317 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  24.39 
 
 		 313 aa  44.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  26.22 
 
 		 293 aa  45.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  25.18 
 
 		 279 aa  44.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  27.07 
 
 		 298 aa  44.3  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  24.67 
 
 		 551 aa  44.3  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>