More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2648 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  635    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  42.4 
 
 		 293 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  38.7 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  33.57 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  31.33 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  27.76 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  25.26 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  29.02 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  27.86 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  27.89 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  27.47 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  26.47 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  27.74 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  27.4 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  26.12 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  31.28 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  26.78 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  27.65 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  27.17 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  29.45 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  27.27 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.14 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.36 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.74 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.88 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  24.65 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.41 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  30.56 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  25.75 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  27.59 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  26.09 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  25.36 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  25.71 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  28.12 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.36 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  26.57 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  32.66 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  27.78 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.17 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.07 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.92 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  27.13 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23.51 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  28.17 
 
 		 287 aa  99.4  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 		 302 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  27.64 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  28.07 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.91 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  30.08 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  28.94 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.28 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.34 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  25.91 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  28.63 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.02 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  29.19 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  24.91 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  24.91 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.91 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  26.32 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.35 
 
 		 292 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.73 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.12 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  26.72 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  24.33 
 
 		 432 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  25.2 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  25.73 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  26.83 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  27.89 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  25.7 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  27.72 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  24.13 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  26.27 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  23.88 
 
 		 393 aa  87  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  23.68 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  25.88 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  24.9 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  23.7 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  22.65 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  24.05 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  24.19 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  27.98 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  25.68 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  23.36 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  25.21 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  22.39 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  25.26 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  27.39 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  25.97 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  22.01 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  22.18 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  20 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  22.46 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  22.01 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  24.81 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>