More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1933 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  599  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  58.9 
 
 		 293 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  44.68 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  42.4 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  35.36 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  30.85 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  28.81 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  30.82 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  31.01 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  29.49 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  30.31 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  28.47 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  29.63 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  24.64 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  26.33 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.86 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.47 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  27.95 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  27.96 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.94 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  27.99 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  28.38 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  31.44 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.9 
 
 		 340 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  26.8 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  30.74 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  26.16 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  27.53 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  31.28 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  28.07 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  30.04 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  31.02 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  31.16 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  27.69 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  30.59 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  30.99 
 
 		 309 aa  105  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  31.33 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  25.34 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  28.07 
 
 		 338 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  26.69 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.47 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  27.72 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  30.26 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.93 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.96 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  27.02 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.69 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  25.09 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.35 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  27.07 
 
 		 353 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  27.24 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  27.86 
 
 		 296 aa  95.5  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  26.14 
 
 		 295 aa  95.5  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  27.72 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  28.37 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  27.4 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.67 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  26.81 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  24.18 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  25.45 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  26.21 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  26.46 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  25.1 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  26.87 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.42 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  25.68 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  25.59 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  24.91 
 
 		 309 aa  89.7  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  25.46 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  25.78 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  30.74 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  26.97 
 
 		 291 aa  89.7  6e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  26.94 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  35.19 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  29.33 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  29.33 
 
 		 314 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  29.33 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  25.34 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  26.62 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  25.53 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  25.53 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  25.53 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  28.89 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  25.09 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  25.62 
 
 		 350 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  24.56 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.42 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  26.07 
 
 		 366 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  23.94 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  25.76 
 
 		 312 aa  85.9  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  26.35 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  26.32 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  26.48 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  29.46 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  26.69 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  25.86 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  26.33 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  25.19 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  30.36 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>