147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0040 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 435 aa  855    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  55.64 
 
 		 423 aa  482  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  35.8 
 
 		 482 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 446 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 506 aa  98.2  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 500 aa  92.8  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 512 aa  86.3  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  28.38 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 546 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.63 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  26.57 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  21.95 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  25.65 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  20.68 
 
 		 583 aa  70.1  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 490 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 		 461 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  22.41 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2629  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  23.76 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  26.34 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  27.64 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 477 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  20.28 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  29.36 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  20.86 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  24.57 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  24.47 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 476 aa  57  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0310  polysaccharide biosynthesis protein  30.65 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 495 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 458 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  19.7 
 
 		 488 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 475 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 468 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  21.27 
 
 		 520 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  24.49 
 
 		 483 aa  53.9  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2969  O-antigen and teichoic acid-like export protein  25.97 
 
 		 449 aa  53.9  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  18.07 
 
 		 539 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  20.33 
 
 		 476 aa  53.9  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  20.7 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  18.7 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  20.6 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  29.83 
 
 		 440 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 507 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2974  stage V sporulation protein B  21.55 
 
 		 512 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 		 494 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 484 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 539 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 455 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 504 aa  50.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 458 aa  50.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  19.86 
 
 		 520 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  20.2 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  19.55 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  28.99 
 
 		 449 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  24.02 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 458 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  20.8 
 
 		 492 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.94 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  20.86 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>