20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0674 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 413 aa  810    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  41.92 
 
 		 423 aa  300  3e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  29.47 
 
 		 612 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  27.74 
 
 		 433 aa  113  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1060  hypothetical protein  29.7 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.945271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7658  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  26.49 
 
 		 719 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  24.04 
 
 		 1197 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  27.16 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0210  hypothetical protein  22.89 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5089  hypothetical protein  25.13 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  24.62 
 
 		 1297 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_192  polysaccharide biosynthesis protein  39.71 
 
 		 129 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.880283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3847  hypothetical protein  23.35 
 
 		 465 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 539 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 		 446 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  24.69 
 
 		 435 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>