20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0215 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  81.84 
 
 		 441 aa  669    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 440 aa  852    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  35.44 
 
 		 423 aa  179  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  30.83 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 		 612 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_192  polysaccharide biosynthesis protein  67.89 
 
 		 129 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.880283  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  29.78 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  28.57 
 
 		 1197 aa  123  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5089  hypothetical protein  25.38 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7658  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  26.56 
 
 		 719 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  25.41 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 		 1297 aa  87  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6732  polysaccharide biosynthesis protein  29.81 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0210  hypothetical protein  25.3 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1060  hypothetical protein  22.57 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.945271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3590  hypothetical protein  27.49 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3847  hypothetical protein  23.38 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>