13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6732 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6732  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
459 aa  884    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6867  polysaccharide biosynthesis protein  33.42 
 
 
439 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3847  hypothetical protein  29.9 
 
 
465 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.506068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  27.35 
 
 
420 aa  87  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  27.15 
 
 
423 aa  77  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  31.44 
 
 
1197 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  28.94 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 
440 aa  57.4  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0210  hypothetical protein  25 
 
 
451 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 
1297 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_192  polysaccharide biosynthesis protein  40 
 
 
129 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.880283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 
612 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>