24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1926 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  100 
 
 
1197 aa  2331    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3591  hypothetical protein  41.44 
 
 
704 aa  346  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0718936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7658  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  39.13 
 
 
719 aa  343  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3590  hypothetical protein  41.2 
 
 
455 aa  213  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7666  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.05 
 
 
1132 aa  181  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  36.31 
 
 
420 aa  174  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  32.11 
 
 
433 aa  173  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0436  putative serine/threonine protein kinase; putative membrane protein  35.29 
 
 
733 aa  157  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1583  hypothetical protein  26.22 
 
 
632 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 
1297 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 
440 aa  102  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 
441 aa  102  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 
612 aa  90.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 
413 aa  74.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0207  hypothetical protein  26.57 
 
 
581 aa  68.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.505984  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0210  hypothetical protein  23.96 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2681  hypothetical protein  24.85 
 
 
735 aa  67.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6732  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 
459 aa  63.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5089  hypothetical protein  21.74 
 
 
408 aa  61.6  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0144  hypothetical protein  28.7 
 
 
539 aa  57.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0209  hypothetical protein  25.93 
 
 
539 aa  55.8  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1060  hypothetical protein  27.03 
 
 
423 aa  53.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.945271 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_192  polysaccharide biosynthesis protein  43.86 
 
 
129 aa  47.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.880283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>