14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7658 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7658  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  100 
 
 		 719 aa  1364    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  39.61 
 
 		 1197 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3590  hypothetical protein  39.52 
 
 		 455 aa  181  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  33.06 
 
 		 420 aa  144  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  29.15 
 
 		 433 aa  130  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 		 441 aa  98.2  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 413 aa  96.7  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 440 aa  90.1  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  24.77 
 
 		 1297 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0210  hypothetical protein  25.91 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 		 612 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3591  hypothetical protein  32.88 
 
 		 704 aa  54.3  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0718936  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5089  hypothetical protein  23.78 
 
 		 408 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>