16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1584 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  797    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  35.86 
 
 		 1197 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  31.96 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7658  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  32.54 
 
 		 719 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 1297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  28.68 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3590  hypothetical protein  29.5 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6732  polysaccharide biosynthesis protein  26.82 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 612 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0210  hypothetical protein  25.73 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5089  hypothetical protein  26.44 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1060  hypothetical protein  30.82 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.945271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3847  hypothetical protein  25.21 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>