15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1060 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1060  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  818    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.945271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  33.42 
 
 		 612 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  26.98 
 
 		 423 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  29.44 
 
 		 413 aa  96.3  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 433 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0210  hypothetical protein  28.42 
 
 		 451 aa  87  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5089  hypothetical protein  26.38 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  30.93 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  27.03 
 
 		 1197 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7658  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  26.52 
 
 		 719 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3847  hypothetical protein  25.87 
 
 		 465 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 		 1297 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>