21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0138 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 441 aa  852    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  81.84 
 
 		 440 aa  625  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  34.92 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  31.08 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 		 612 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_192  polysaccharide biosynthesis protein  60.48 
 
 		 129 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.880283  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  29.16 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  26.23 
 
 		 1197 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5089  hypothetical protein  25.9 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  28.68 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7658  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  26.87 
 
 		 719 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1060  hypothetical protein  24.66 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.945271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0210  hypothetical protein  27.05 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6732  polysaccharide biosynthesis protein  29.65 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 1297 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3847  hypothetical protein  22.66 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 499 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3590  hypothetical protein  30.89 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 486 aa  43.9  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>