20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0437 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 433 aa  838    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 		 1297 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0210  hypothetical protein  33.79 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  32.11 
 
 		 1197 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  32.86 
 
 		 420 aa  155  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  31.33 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  30.83 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7658  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  28.74 
 
 		 719 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3590  hypothetical protein  31.87 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  28.37 
 
 		 612 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5089  hypothetical protein  25.2 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1060  hypothetical protein  30.95 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.945271 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6732  polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3847  hypothetical protein  25.68 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.65 
 
 		 461 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_192  polysaccharide biosynthesis protein  43.33 
 
 		 129 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.880283  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  30.89 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 490 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>