81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4156 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  43.71 
 
 		 1186 aa  775    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  100 
 
 		 1151 aa  2385    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  44.97 
 
 		 1154 aa  991    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  42.65 
 
 		 1188 aa  902    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  47.46 
 
 		 1173 aa  1094    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  42.62 
 
 		 1184 aa  879    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  44.3 
 
 		 1170 aa  964    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  54.16 
 
 		 1018 aa  1094    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  41.25 
 
 		 869 aa  634  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  31.69 
 
 		 918 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  31.06 
 
 		 925 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  31.09 
 
 		 973 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  32.68 
 
 		 621 aa  309  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  35.57 
 
 		 430 aa  251  7e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25.62 
 
 		 978 aa  230  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3224  hypothetical protein  41.51 
 
 		 332 aa  207  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  22.88 
 
 		 908 aa  189  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  25.35 
 
 		 916 aa  186  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  23.08 
 
 		 909 aa  182  4e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  24.97 
 
 		 871 aa  175  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  23.53 
 
 		 914 aa  175  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  23.64 
 
 		 928 aa  168  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  24.35 
 
 		 933 aa  168  6.9999999999999995e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  28.6 
 
 		 1409 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  23.45 
 
 		 912 aa  162  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  24.55 
 
 		 937 aa  162  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1353 aa  161  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  23.42 
 
 		 919 aa  159  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1282 aa  159  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  21.58 
 
 		 934 aa  154  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1363 aa  154  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  24.68 
 
 		 928 aa  153  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  24.2 
 
 		 955 aa  152  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1346 aa  152  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1321 aa  149  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  24.64 
 
 		 928 aa  147  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1342 aa  147  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1339 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1339 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1365 aa  142  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  23.12 
 
 		 926 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1290 aa  140  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1347 aa  137  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.89 
 
 		 926 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1461 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.74 
 
 		 909 aa  131  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1440 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.26 
 
 		 918 aa  130  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  21.47 
 
 		 929 aa  129  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  25.9 
 
 		 536 aa  128  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1366 aa  127  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  23.55 
 
 		 932 aa  127  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  20.72 
 
 		 934 aa  126  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1243 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1441 aa  124  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1347 aa  122  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  22.77 
 
 		 921 aa  115  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.47 
 
 		 929 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  22 
 
 		 941 aa  111  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1452 aa  110  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  28.21 
 
 		 333 aa  109  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  23.88 
 
 		 512 aa  78.6  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  22.79 
 
 		 974 aa  65.9  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2741  hypothetical protein  37.61 
 
 		 118 aa  63.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  21.94 
 
 		 1041 aa  56.6  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1298 aa  55.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1338 aa  53.5  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1022 aa  52  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  39.53 
 
 		 1359 aa  50.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1339 aa  50.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1184 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  21.03 
 
 		 622 aa  49.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.2 
 
 		 950 aa  48.5  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  27.36 
 
 		 792 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.36 
 
 		 1432 aa  48.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  25.89 
 
 		 1354 aa  47.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  26.83 
 
 		 1159 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1241 aa  46.6  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1195 aa  45.8  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  22.37 
 
 		 1038 aa  45.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1422 aa  45.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>