More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0417 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  100 
 
 		 346 aa  659    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  56.92 
 
 		 363 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  56.41 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  56.59 
 
 		 349 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  54.92 
 
 		 349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  56.83 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  46.65 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  51.13 
 
 		 343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  46.18 
 
 		 352 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  49.12 
 
 		 354 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  47.71 
 
 		 353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  39.81 
 
 		 375 aa  245  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  36.76 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  37.95 
 
 		 378 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  38.18 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  40.91 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  32.54 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  34.28 
 
 		 369 aa  199  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  37.22 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  33.14 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  30.55 
 
 		 365 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  29.75 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  32.2 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  38.69 
 
 		 340 aa  186  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  35.13 
 
 		 348 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.08 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  29.49 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  34.17 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  29.65 
 
 		 393 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  38.73 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  31.59 
 
 		 369 aa  169  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  35.29 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.42 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  29.64 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  35.48 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  33.87 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  35.47 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  35.47 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  30.9 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  30.9 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 340 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  30.19 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 324 aa  126  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  28.13 
 
 		 375 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  28.23 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 375 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  31.32 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.88 
 
 		 354 aa  92.8  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 384 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  31.03 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.67 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  29.36 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 358 aa  86.3  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  29.87 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  30.81 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.69 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  26.51 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  26.44 
 
 		 368 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  24.6 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  31.25 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  25.07 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  28.26 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.36 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  23.71 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  25.38 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.9 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  24.78 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  31.87 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  26.88 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  27.54 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 689 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.17 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  22.93 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  23.7 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.14 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  29.95 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  28.35 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  26.81 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>