More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2097 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 		 633 aa  1282    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  59.59 
 
 		 492 aa  570  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.68 
 
 		 636 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46 
 
 		 609 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.54 
 
 		 607 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.05 
 
 		 658 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  45.27 
 
 		 484 aa  352  8.999999999999999e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  42.82 
 
 		 484 aa  339  9e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  42.86 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.38 
 
 		 471 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  41.01 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  38.24 
 
 		 491 aa  306  9.000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.59 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.56 
 
 		 445 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.98 
 
 		 471 aa  213  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.69 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  29.84 
 
 		 469 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.49 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.13 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.66 
 
 		 450 aa  206  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.83 
 
 		 452 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.98 
 
 		 475 aa  204  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.69 
 
 		 473 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.69 
 
 		 473 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  28.7 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.87 
 
 		 501 aa  201  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.03 
 
 		 471 aa  200  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.03 
 
 		 471 aa  200  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  31.06 
 
 		 436 aa  200  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.09 
 
 		 470 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.25 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.8 
 
 		 471 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  29.55 
 
 		 437 aa  197  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.84 
 
 		 452 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  30.73 
 
 		 445 aa  196  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.84 
 
 		 452 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.92 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.83 
 
 		 457 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.25 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.5 
 
 		 450 aa  193  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.79 
 
 		 468 aa  192  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  30.47 
 
 		 436 aa  192  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.17 
 
 		 451 aa  191  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  31.62 
 
 		 423 aa  190  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.66 
 
 		 456 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  28.48 
 
 		 469 aa  187  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  29.7 
 
 		 440 aa  186  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  31.26 
 
 		 425 aa  186  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.7 
 
 		 441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.57 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  32.11 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.22 
 
 		 450 aa  174  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.66 
 
 		 442 aa  173  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  28 
 
 		 574 aa  166  9e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  27.91 
 
 		 574 aa  164  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.68 
 
 		 431 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.76 
 
 		 566 aa  157  8e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.02 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.13 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.6 
 
 		 440 aa  147  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.56 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  25 
 
 		 559 aa  144  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.03 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.12 
 
 		 443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.73 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.64 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.16 
 
 		 524 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.97 
 
 		 475 aa  117  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27 
 
 		 519 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.66 
 
 		 460 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.42 
 
 		 522 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.41 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  27.21 
 
 		 456 aa  109  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.2 
 
 		 476 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.87 
 
 		 518 aa  108  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.53 
 
 		 463 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  26.97 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.79 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.27 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  27.86 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.32 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  26.93 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.38 
 
 		 489 aa  100  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.59 
 
 		 497 aa  100  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.59 
 
 		 488 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.83 
 
 		 497 aa  98.6  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.36 
 
 		 494 aa  97.8  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.61 
 
 		 463 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.47 
 
 		 464 aa  97.4  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.11 
 
 		 472 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.93 
 
 		 488 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.27 
 
 		 453 aa  90.5  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  21.15 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  24.38 
 
 		 425 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  20.91 
 
 		 455 aa  89  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0054  outer membrane efflux protein  26.99 
 
 		 520 aa  87  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.906913  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.82 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.57 
 
 		 463 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.79 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.08 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>