205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0478 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  100 
 
 		 313 aa  627  1e-179  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  42.24 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  41.53 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  27.21 
 
 		 306 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  29.45 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  24.43 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  26.15 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  26.4 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  24.15 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  23.9 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  22.71 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  21.86 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  23.03 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  24.07 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  23.87 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  22.83 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.36 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  24.37 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  27.19 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  22.4 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  21.43 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  20.58 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  24.12 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  23.18 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  24.14 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  23.84 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.15 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  23.89 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  23.89 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  23.51 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  23.57 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.15 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  23.57 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.15 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  23.61 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  24.03 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  24.88 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  22.98 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  26.69 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  22.45 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  22.61 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  23.7 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  21.57 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  22.26 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  22.46 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  21.85 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  22.57 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  25.39 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  24.06 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  21.26 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  21.31 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  19.55 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  21.12 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  20.63 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  20.57 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  24.04 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  24.04 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  24.59 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  22.15 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0231  Auxin Efflux Carrier  24.5 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  23.56 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  23.56 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  21.58 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  21.94 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  24.41 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  22.74 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  20 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  23.56 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  20.07 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  23.55 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0393  auxin efflux carrier  21.96 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.193838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  23.36 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl378  putative malate permease  23.88 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00181324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  23.47 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  21.58 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  22.74 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  24.2 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  22.58 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.02 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  22.3 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  22.3 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  21.72 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  21.33 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  22.3 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  22.03 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  21.92 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.89 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  21.94 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  23.53 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  20.58 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  21.92 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  18.27 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  21.82 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  25.16 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  24.53 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  21.17 
 
 		 322 aa  52.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>