14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl378 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl378  putative malate permease  100 
 
 
376 aa  737    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00181324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  32.1 
 
 
349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  32.1 
 
 
349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0231  Auxin Efflux Carrier  30.14 
 
 
353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  23.21 
 
 
313 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  23.56 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf736  hypothetical protein  29.77 
 
 
453 aa  52  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  23.62 
 
 
322 aa  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  22.37 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  21.52 
 
 
320 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  21.52 
 
 
320 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  22.32 
 
 
320 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  26.04 
 
 
318 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  26.04 
 
 
318 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>