More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0726 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
480 aa  892    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  47.5 
 
 
497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.58 
 
 
504 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  48.69 
 
 
490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.38 
 
 
495 aa  303  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.37 
 
 
494 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.73 
 
 
459 aa  292  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.44 
 
 
536 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  44.47 
 
 
500 aa  273  7e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.54 
 
 
495 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.94 
 
 
526 aa  271  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  48.98 
 
 
558 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.5 
 
 
497 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  44.4 
 
 
533 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  45.3 
 
 
481 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  46.35 
 
 
473 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.26 
 
 
485 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  46.26 
 
 
485 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.26 
 
 
485 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.96 
 
 
487 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  46.42 
 
 
576 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.48 
 
 
473 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.11 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.86 
 
 
471 aa  233  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.95 
 
 
511 aa  233  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.83 
 
 
499 aa  233  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.61 
 
 
483 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  43.9 
 
 
476 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.72 
 
 
485 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  40.14 
 
 
587 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.11 
 
 
465 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.62 
 
 
480 aa  207  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.84 
 
 
501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  44.77 
 
 
526 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  43.04 
 
 
532 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.54 
 
 
524 aa  169  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.36 
 
 
499 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.1 
 
 
502 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  42.8 
 
 
534 aa  167  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  36.04 
 
 
499 aa  166  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  41.33 
 
 
525 aa  162  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.68 
 
 
504 aa  160  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.14 
 
 
499 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.21 
 
 
499 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  35.96 
 
 
499 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.28 
 
 
499 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  34.12 
 
 
499 aa  156  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.62 
 
 
515 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.38 
 
 
494 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.07 
 
 
494 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.19 
 
 
519 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  33.87 
 
 
492 aa  151  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  32.89 
 
 
504 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.07 
 
 
494 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.41 
 
 
499 aa  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.88 
 
 
492 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.39 
 
 
492 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  32.89 
 
 
504 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  32.89 
 
 
504 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.59 
 
 
510 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.2 
 
 
494 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.52 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  34.19 
 
 
496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  32.55 
 
 
514 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0847  YjeF domain protein  37.5 
 
 
383 aa  148  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.78 
 
 
488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  35.11 
 
 
499 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.46 
 
 
523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.68 
 
 
508 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.93 
 
 
492 aa  140  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.72 
 
 
521 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.62 
 
 
457 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.63 
 
 
528 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  35 
 
 
503 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  28.41 
 
 
463 aa  138  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.01 
 
 
499 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  27.76 
 
 
466 aa  137  5e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  34.34 
 
 
513 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.97 
 
 
511 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1232  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.91 
 
 
496 aa  137  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271029  normal  0.25171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.11 
 
 
496 aa  136  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.26 
 
 
520 aa  136  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  33.88 
 
 
514 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1145  YjeF-related protein-like protein  37.44 
 
 
495 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0478432  normal  0.107568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.18 
 
 
518 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.5 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.61 
 
 
490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  29.46 
 
 
517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.96 
 
 
490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.64 
 
 
515 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  28.51 
 
 
490 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.89 
 
 
514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  32.64 
 
 
510 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  31 
 
 
498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  32.44 
 
 
515 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  37.98 
 
 
507 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  33.06 
 
 
510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  35.16 
 
 
499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.48 
 
 
539 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  34.73 
 
 
514 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>