More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1077 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1077  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 522 aa  1058    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2700  ABC transporter substrate binding protein (agrocinopine)  31.77 
 
 		 521 aa  253  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1001  twin-arginine translocation pathway signal  31.35 
 
 		 542 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2857  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 542 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.791512  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6464  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  29.63 
 
 		 545 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1837  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 544 aa  196  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2237  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 550 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  29.72 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  29.78 
 
 		 526 aa  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  29.84 
 
 		 525 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  30.39 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  27.4 
 
 		 514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 509 aa  143  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  30.5 
 
 		 497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.54 
 
 		 530 aa  141  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.65 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 534 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  30.02 
 
 		 524 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 495 aa  130  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4734  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  27.87 
 
 		 527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  28.31 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 		 537 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 		 520 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.27 
 
 		 545 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.73 
 
 		 512 aa  123  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 		 589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5080  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0526207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 		 495 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 		 532 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 527 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4493  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 577 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 515 aa  120  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  27.75 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1250  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 		 550 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.405882  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.43 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 549 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 		 489 aa  118  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  27.86 
 
 		 532 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 538 aa  117  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 507 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1024  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 524 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 		 514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.95 
 
 		 505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.19 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  30.3 
 
 		 523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.3 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.72 
 
 		 520 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 544 aa  114  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5398  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  28.81 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 521 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  24.35 
 
 		 518 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 		 510 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7174  peptide ABC transporter substrate-binding protein  27.44 
 
 		 503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 		 519 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4444  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 517 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.300506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.12 
 
 		 509 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3824  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 524 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1968  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 518 aa  110  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 532 aa  110  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 535 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 522 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  26.63 
 
 		 562 aa  110  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  26.65 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.3 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 		 519 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3985  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 544 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.37 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 532 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 532 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3647  extracellular solute-binding protein family 5  29.97 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0862095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 528 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 532 aa  108  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>