55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2860 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  59.82 
 
 
680 aa  761    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  61.46 
 
 
684 aa  842    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  100 
 
 
678 aa  1373    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  61.18 
 
 
697 aa  809    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  67.6 
 
 
679 aa  884    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  29.66 
 
 
716 aa  282  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  27.43 
 
 
652 aa  240  8e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  27.91 
 
 
644 aa  232  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  27.61 
 
 
641 aa  228  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  26.6 
 
 
647 aa  219  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  24.33 
 
 
660 aa  201  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  27.57 
 
 
715 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  26.97 
 
 
802 aa  167  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  24.31 
 
 
807 aa  167  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  24.04 
 
 
625 aa  167  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  26.45 
 
 
536 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2054  serine/threonine protein kinase  40.51 
 
 
633 aa  141  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.647087  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  23.71 
 
 
601 aa  137  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  24.66 
 
 
625 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  30.55 
 
 
306 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  22.67 
 
 
610 aa  120  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  23.62 
 
 
328 aa  107  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  26.65 
 
 
349 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  28.64 
 
 
307 aa  98.6  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  29.48 
 
 
300 aa  96.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  25.4 
 
 
329 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  28.84 
 
 
224 aa  96.3  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  28.79 
 
 
349 aa  95.5  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  27.24 
 
 
296 aa  93.6  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  29.86 
 
 
332 aa  93.6  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  23.58 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  25.35 
 
 
558 aa  64.7  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  27.46 
 
 
558 aa  63.9  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  24.65 
 
 
558 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  24.65 
 
 
558 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  27.01 
 
 
284 aa  61.2  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  23.94 
 
 
558 aa  61.2  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  22.11 
 
 
581 aa  60.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  22.97 
 
 
582 aa  57.4  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  23.74 
 
 
295 aa  57.4  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  24.61 
 
 
578 aa  57  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  20.66 
 
 
590 aa  53.5  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  22.05 
 
 
604 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  20.39 
 
 
574 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  23.46 
 
 
551 aa  52.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  19.81 
 
 
450 aa  50.8  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  22.09 
 
 
554 aa  50.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  24.53 
 
 
284 aa  49.3  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1198  type II secretion system protein  24.37 
 
 
620 aa  48.9  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.665055  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  22.54 
 
 
282 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  20.61 
 
 
282 aa  45.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  31.52 
 
 
311 aa  44.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  33.33 
 
 
312 aa  45.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  25.36 
 
 
300 aa  44.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  24.4 
 
 
290 aa  44.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>