More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2679 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  74.33 
 
 		 599 aa  915    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  73.46 
 
 		 607 aa  894    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 602 aa  1193    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  74.5 
 
 		 597 aa  900    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  81.29 
 
 		 604 aa  934    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  52.46 
 
 		 591 aa  629  1e-179  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 591 aa  620  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 602 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  49.67 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  48.15 
 
 		 591 aa  585  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  48.15 
 
 		 604 aa  579  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  48.64 
 
 		 589 aa  578  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  46.98 
 
 		 593 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  46.52 
 
 		 578 aa  548  1e-154  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  45.74 
 
 		 598 aa  531  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  45.74 
 
 		 598 aa  529  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  45.08 
 
 		 598 aa  524  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  42.9 
 
 		 598 aa  511  1e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  44.41 
 
 		 598 aa  499  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  42.59 
 
 		 597 aa  461  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  42.64 
 
 		 600 aa  457  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  41.29 
 
 		 592 aa  437  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  40.44 
 
 		 588 aa  432  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  42.27 
 
 		 601 aa  429  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  40.71 
 
 		 589 aa  430  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  38.89 
 
 		 593 aa  426  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  40.5 
 
 		 592 aa  426  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  41.02 
 
 		 594 aa  420  1e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  36.84 
 
 		 1072 aa  362  1e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  34.35 
 
 		 623 aa  353  7e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  39.48 
 
 		 1228 aa  349  8e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  37.26 
 
 		 599 aa  343  4e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  35.49 
 
 		 997 aa  329  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  28.69 
 
 		 692 aa  188  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  29.95 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1473  translation initiation factor IF-2  30.09 
 
 		 579 aa  184  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147864  unclonable  0.00000476955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  30.34 
 
 		 688 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  30.2 
 
 		 686 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  30.2 
 
 		 686 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  30.16 
 
 		 686 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  30.16 
 
 		 686 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  30.29 
 
 		 601 aa  182  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  30.2 
 
 		 688 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  29.6 
 
 		 905 aa  181  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  30.16 
 
 		 686 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  30.02 
 
 		 686 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  30.02 
 
 		 686 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  30.09 
 
 		 689 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  29.98 
 
 		 732 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  30.36 
 
 		 705 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  30.36 
 
 		 705 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  30.19 
 
 		 848 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 602 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  29.75 
 
 		 658 aa  177  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 		 656 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  28.86 
 
 		 874 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  29.93 
 
 		 992 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  29.84 
 
 		 992 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  30.27 
 
 		 720 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  28.62 
 
 		 679 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  28.75 
 
 		 679 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  29.71 
 
 		 1030 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  29.21 
 
 		 593 aa  174  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  29.76 
 
 		 908 aa  174  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0667  translation initiation factor IF-2  29.47 
 
 		 826 aa  174  5e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560866 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  29.45 
 
 		 903 aa  173  6.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  29.46 
 
 		 908 aa  173  6.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  30.59 
 
 		 739 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  29.59 
 
 		 904 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  27.72 
 
 		 614 aa  172  2e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_855  translation initiation factor 2 (IF-2)  29.6 
 
 		 593 aa  172  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00962289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  30.31 
 
 		 822 aa  172  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  29.16 
 
 		 838 aa  172  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  29.59 
 
 		 966 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  28.57 
 
 		 1059 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  28.45 
 
 		 686 aa  170  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  30.34 
 
 		 920 aa  170  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  30.12 
 
 		 979 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  28.6 
 
 		 593 aa  169  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl295  translation initiation factor IF-2  27.56 
 
 		 629 aa  167  4e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000364465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  29.42 
 
 		 985 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  28.77 
 
 		 914 aa  167  5e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  29.44 
 
 		 883 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  28.15 
 
 		 1101 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  29.32 
 
 		 689 aa  166  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  28.74 
 
 		 924 aa  166  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  28.32 
 
 		 1005 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  28.77 
 
 		 845 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  29.48 
 
 		 965 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  29.02 
 
 		 868 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  28.8 
 
 		 690 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  28.78 
 
 		 693 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  30.18 
 
 		 888 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  29.89 
 
 		 949 aa  166  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  29.14 
 
 		 885 aa  165  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  28.19 
 
 		 854 aa  165  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  29.1 
 
 		 853 aa  165  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  29.91 
 
 		 969 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  28.4 
 
 		 995 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2814  translation initiation factor IF-2  27.77 
 
 		 845 aa  164  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572575  hitchhiker  0.00404831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>