More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4327 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4327  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 507 aa  1014    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.945677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2309  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  40.12 
 
 		 513 aa  346  6e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00141019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1300  putative phytochrome sensor protein  40.13 
 
 		 518 aa  279  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0346  formate hydrogenlyase transcriptional activator, putative  40 
 
 		 518 aa  279  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29620  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  43.53 
 
 		 517 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3059  formate hydrogenlyase transcriptional activator, putative  40.29 
 
 		 508 aa  273  7e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1464  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  47.87 
 
 		 1139 aa  273  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0831  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  42.75 
 
 		 518 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1347  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  44.28 
 
 		 1082 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0845  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  42.35 
 
 		 518 aa  272  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000422276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1095  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  39.81 
 
 		 530 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.736443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3090  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  42.6 
 
 		 518 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000341917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6323  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  43.28 
 
 		 525 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3407  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  40.39 
 
 		 552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0882  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  42.6 
 
 		 518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00745521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2534  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  43.28 
 
 		 517 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0807  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  42.5 
 
 		 518 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0851  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  38.57 
 
 		 527 aa  270  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.641231  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4025  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  42.82 
 
 		 532 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1488  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.35 
 
 		 508 aa  269  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2282  Fis family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 507 aa  269  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3579  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  43.78 
 
 		 516 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.709796 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2337  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.59 
 
 		 521 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4653  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  40.84 
 
 		 517 aa  267  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0846  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  41.79 
 
 		 518 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.615084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2429  NifA subfamily transcriptional regulator  42.28 
 
 		 522 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0629809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1092  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  44.84 
 
 		 647 aa  266  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0688  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  38.46 
 
 		 528 aa  267  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1739  Sigma 54 interacting domain protein  40 
 
 		 479 aa  266  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3698  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  39.36 
 
 		 526 aa  266  8e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0902  Fis family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 551 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2869  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  46.08 
 
 		 648 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.990966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4379  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  41 
 
 		 516 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1411  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  45.6 
 
 		 664 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0903  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  45.43 
 
 		 693 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0274  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  43.29 
 
 		 474 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51080  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  44.36 
 
 		 514 aa  264  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3993  Fis family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 486 aa  263  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000527576  normal  0.307332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1785  NifA subfamily transcriptional regulator  39.25 
 
 		 507 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3444  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  40.39 
 
 		 516 aa  263  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03872  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  39.47 
 
 		 506 aa  263  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2433  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.73 
 
 		 508 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2109  Fis family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 473 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3254  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  38.32 
 
 		 516 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0727  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  40 
 
 		 506 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1305  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  41.32 
 
 		 529 aa  262  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3082  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.35 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  47.04 
 
 		 657 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2552  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  43.18 
 
 		 525 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2456  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  43.18 
 
 		 525 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0352047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  42.41 
 
 		 875 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2223  NifA subfamily transcriptional regulator  41.76 
 
 		 556 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0251727  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3906  transcriptional regulator, Fis family protein  44.62 
 
 		 480 aa  261  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3238  putative PAS/PAC sensor protein  44.94 
 
 		 624 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1401  NifA subfamily transcriptional regulator  42.93 
 
 		 562 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3823  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  39.23 
 
 		 517 aa  260  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2313  Fis family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 510 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0764  transcriptional regulator NifA  48.34 
 
 		 511 aa  259  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.13 
 
 		 635 aa  259  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6163  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  41.75 
 
 		 531 aa  259  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2667  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  44.38 
 
 		 551 aa  258  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3475  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  39.9 
 
 		 529 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.232815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0582  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  41.41 
 
 		 517 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1920  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  40.25 
 
 		 512 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2053  Fis family transcriptional regulator  47.38 
 
 		 664 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2997  putative PAS/PAC sensor protein  47.81 
 
 		 629 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127618 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3693  Fis family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4854  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.32 
 
 		 541 aa  257  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.246176  normal  0.0147757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2770  PAS sensor protein  47.34 
 
 		 629 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4753  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  47.8 
 
 		 557 aa  257  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.050677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3181  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  40.93 
 
 		 530 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0067  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  40.42 
 
 		 550 aa  257  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0861439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3320  Fis family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 484 aa  257  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2332  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  42.5 
 
 		 530 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1896  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  41.71 
 
 		 531 aa  257  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0137068  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0656  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  39.37 
 
 		 511 aa  257  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0760  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  38.15 
 
 		 525 aa  257  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1588  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 458 aa  256  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3032  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  41.77 
 
 		 510 aa  256  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2966  transcriptional regulator NifA  42.25 
 
 		 515 aa  256  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3073  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  40.49 
 
 		 517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000195534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.32 
 
 		 488 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1032  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1282  putative GAF sensor protein  38.3 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.27 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5933  NifA subfamily transcriptional regulator  44.28 
 
 		 580 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3404  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  55.27 
 
 		 455 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235439  normal  0.675632 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001300  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator NorR  41.65 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.208791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5338  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.05 
 
 		 462 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5444  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  44.24 
 
 		 515 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.37 
 
 		 650 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2253  Fis family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 648 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.358713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2443  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.3 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2893  transcriptional regulator, Fis family  48.11 
 
 		 630 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.359739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2402  transcriptional regulator, Fis family  46.15 
 
 		 641 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1807  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.86 
 
 		 454 aa  253  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1146  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  40.93 
 
 		 522 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3259  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  41.59 
 
 		 508 aa  253  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0440115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47100  sigma54-dependent activator protein  40.7 
 
 		 517 aa  252  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3367  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 508 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>