More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2154 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 316 aa  629  1e-179  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  67.88 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  62.29 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  37.81 
 
 		 359 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 408 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  25.58 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  27.63 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 225 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 330 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  24.89 
 
 		 523 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  29.63 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  29.63 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  29.63 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  29.63 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  24.43 
 
 		 523 aa  72  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  29.63 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  24.89 
 
 		 523 aa  72  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 657 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  23.47 
 
 		 509 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  27.68 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  23.86 
 
 		 529 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  27.38 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  27.55 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  27.55 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  27.55 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  29.34 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  27.55 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  27.55 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  27.55 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  27.55 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  24.18 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  29.38 
 
 		 667 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.81 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  23.98 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.81 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  20.07 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  28.12 
 
 		 526 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  22 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  23.89 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  20.86 
 
 		 548 aa  63.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  26.04 
 
 		 536 aa  62.8  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  28.23 
 
 		 545 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  19.49 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  33.87 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  28.57 
 
 		 813 aa  59.7  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  23.32 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  26.53 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  25.22 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  25.29 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  31.4 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  25.82 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  25.14 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 566 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  30 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.2 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3690  MscS mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  27.36 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  24.35 
 
 		 476 aa  57  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  25.98 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  31.21 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  25.93 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  24.69 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  26.09 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  26.24 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>