140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1504 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.46 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.76 
 
 		 113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.95 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.64 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.34 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  46.34 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  36.27 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.58 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  33.67 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  42.68 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  35.37 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  37.8 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  41.46 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3664  hypothetical protein  39.33 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.91 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.07 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  33.65 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  28.57 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  28.57 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.07 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  28.57 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  34.23 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.97 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.28 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  30.84 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  32 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.92 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  36.26 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  36.26 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 292 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.06 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.83 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1024  cupin 2 domain-containing protein  34.52 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  36.26 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  35.62 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.08 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  35.56 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  34.88 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  32.43 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  37.04 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  34.88 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  34.88 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  30.43 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8205  hypothetical protein  32.67 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  29.59 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  29 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  29.36 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.62 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  35.71 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  30.88 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 421 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  40.74 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410893  normal  0.322015 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 115 aa  44.3  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  31.31 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.94 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.03 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  29.03 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  33.82 
 
 		 345 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.97 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>