More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0708 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
152 aa  304  3e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  86.18 
 
 
152 aa  267  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1460  transcriptional regulator, AsnC family  78.95 
 
 
154 aa  256  5.0000000000000005e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  77.63 
 
 
153 aa  249  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2297  transcriptional regulator, AsnC family  77.63 
 
 
154 aa  246  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  76.97 
 
 
153 aa  244  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  73.68 
 
 
153 aa  238  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  50.33 
 
 
151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  47.26 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  44.96 
 
 
152 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
147 aa  92  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  24.46 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  30.07 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  26.28 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  32.09 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  32.38 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  28.03 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  36.27 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  30.37 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  27.41 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.81 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  23.74 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  30.08 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  30.72 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  30.72 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  30.72 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  32.98 
 
 
164 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  32.98 
 
 
164 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  24.14 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  33.67 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  28.36 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  30.07 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  29.85 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  33.65 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  31.3 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  29.05 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  29.41 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  30.53 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  37.63 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  37.63 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  29.85 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.08 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  27.87 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  37.63 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  32.04 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 
196 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  27.01 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  30.3 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.21 
 
 
173 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  29.32 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  28.03 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  33.65 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
173 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>