232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0404 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
313 aa  594  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  50 
 
 
302 aa  256  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  48.98 
 
 
302 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  51.06 
 
 
302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0068  Auxin Efflux Carrier  50.89 
 
 
302 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.723406  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  29.45 
 
 
308 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  25.35 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  27.65 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  29.62 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  26.46 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  28.42 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  26.35 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  27.62 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  26.26 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  26.39 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  24.46 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  25.7 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  26.37 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  27.06 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  26.39 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  25.69 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  30.49 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  28.38 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  25.69 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  25.58 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.61 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  26.1 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.15 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  27.91 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  28.32 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  25.85 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  24.83 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.36 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  30.32 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  25.64 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  26.39 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  26.39 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  25.09 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  27.6 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  24.91 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  29.64 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  25.51 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  31.13 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  26.39 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  27.95 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  26.39 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  26.73 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  25.36 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  27.81 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  30.98 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  27.99 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.67 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  28.9 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  27.99 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  26.62 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  22.73 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.66 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  23.08 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  29.08 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  24.13 
 
 
306 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  24.67 
 
 
320 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  25.68 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  25.96 
 
 
317 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  26.57 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  27.57 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  27.21 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  29.39 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  27.21 
 
 
308 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  24.6 
 
 
315 aa  62.8  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  23.67 
 
 
312 aa  62.4  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.82 
 
 
315 aa  62.4  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.65 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  29.52 
 
 
350 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  26.88 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  26.88 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  27.74 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  28.57 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  24.28 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  27.15 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  24.59 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  26.6 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  26.6 
 
 
319 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.15 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  26.47 
 
 
315 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  26.15 
 
 
316 aa  59.7  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  30.52 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  24.17 
 
 
316 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  23.36 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  23.72 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  27.68 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.48 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  23.55 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  27.54 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>