106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2387 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 92 aa  193  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.13 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  57.58 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.78 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  57.35 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.19 
 
 		 91 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  40.45 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  50.62 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  47.19 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  46.25 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  47.5 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.75 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  38.89 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  41.57 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  37.8 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  46.48 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.44 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.33 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  41.46 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  46.48 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  36.59 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  43.66 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  41.46 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  45.07 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  40.23 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  39.02 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.51 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  38.67 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  43.21 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  37.78 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.71 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.66 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.26 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  38.67 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  40.85 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  36 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.11 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  39.44 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  34.18 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  40.85 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  36.49 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.25 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  32.58 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.25 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  35.21 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  40.85 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.44 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  44 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  34.18 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  38.46 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.38 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  44.87 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.14 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.62 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  36.49 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  32.88 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  60.53 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.724313 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  34.12 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  36.05 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  33.8 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.62 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  37.68 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  36.62 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  35 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  34.62 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  26.37 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31570  CRISPR-associated protein Cas2  34.25 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.63 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1728  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.21 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  31.65 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.88 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.47 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.1 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.05 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.44 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  35.94 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  36.67 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.05 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.05 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  38.46 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.21 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  34.85 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  28.21 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.03 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  30.86 
 
 		 96 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  31.17 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.63 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1871  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.4 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.56 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0734  hypothetical protein  40.82 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0419204  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.85 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  29.58 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.16 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>