47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12830 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  228  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  47.37 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.78 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  43.66 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.44 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.3 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  34.58 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.74 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  41.18 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  42.25 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  45.31 
 
 
90 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  35.87 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.24 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.19 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  36.36 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  39.44 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  41.18 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.81 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  40.38 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  38.81 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.39 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  41.67 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.68 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  35.21 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  35.21 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.81 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  36.11 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  35.23 
 
 
91 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.67 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  34.21 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  41.67 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  36.49 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  40.26 
 
 
99 aa  42.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.36 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.62 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  33.78 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  28.24 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  47.5 
 
 
54 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.724313 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  35.21 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.14 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.67 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.35 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.38 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1141  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.33 
 
 
90 aa  40.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.210554  hitchhiker  0.00000272687 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.82 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>