43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3118 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  236  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  41.05 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  38.78 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.68 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.01 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  44.62 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.25 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  38.36 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.8 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  39.06 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  38.67 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.36 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  36.46 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  31.11 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.67 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.05 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  31.46 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  32.29 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.71 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  28.72 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.58 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.3 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  30.77 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  30.21 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  26.97 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.32 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.04 
 
 		 96 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.12 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  29.07 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  28.38 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  28.26 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.02 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.17 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  25.76 
 
 		 93 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>