91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3645 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 
99 aa  204  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  90.91 
 
 
99 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  77.08 
 
 
96 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  68.75 
 
 
106 aa  146  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  59.38 
 
 
96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  59.6 
 
 
99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.21 
 
 
96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  58.33 
 
 
96 aa  124  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.21 
 
 
96 aa  123  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  58.33 
 
 
96 aa  122  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  58.33 
 
 
96 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  55.21 
 
 
96 aa  120  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.68 
 
 
95 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  54.74 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  51.58 
 
 
96 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  54.17 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  52.08 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  53.12 
 
 
96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1728  CRISPR-associated Cas2 family protein  50.53 
 
 
96 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  50.53 
 
 
96 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  49.48 
 
 
97 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.92 
 
 
96 aa  97.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  45.83 
 
 
96 aa  94  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31570  CRISPR-associated protein Cas2  50 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  54.74 
 
 
96 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.83 
 
 
96 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  42.71 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2357  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.86 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  44.68 
 
 
99 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  44.68 
 
 
99 aa  83.6  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  45.74 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  45.83 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  42.68 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  44.79 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  35.42 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  34.83 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.62 
 
 
96 aa  62.8  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  37.37 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  37.37 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.74 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  30.21 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  35.05 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  39.76 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  37.84 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.49 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2991  hypothetical protein  47.37 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.88 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.14 
 
 
87 aa  50.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.05 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  32.98 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.6 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.14 
 
 
91 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  33.78 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.94 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.71 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  29.9 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  32.53 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.93 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.28 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  36.84 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  31.76 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.58 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  32.29 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.91 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  30.34 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  34.38 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 
92 aa  43.9  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.68 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  34.12 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  35.38 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.03 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  30.34 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  25.58 
 
 
93 aa  42  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  36.23 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  30.59 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  28.87 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.76 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.78 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.73 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.08 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.35 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.39 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.73 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  36.36 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.34 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.61 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  28.38 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.828783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>