69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2515 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 87 aa  175  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  70.24 
 
 		 87 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  62.65 
 
 		 87 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  60.92 
 
 		 87 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  61.45 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  64.29 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  59.77 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  59.04 
 
 		 87 aa  107  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  57.83 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  63.75 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  61.04 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  59.76 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  60.92 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  58.02 
 
 		 87 aa  93.6  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  52.87 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  47.62 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  48.28 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.24 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  54.55 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  47.13 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.83 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.43 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.53 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.06 
 
 		 89 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  36.78 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  44.44 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  44.05 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  42.53 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.23 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.94 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.78 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.24 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.38 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  40.91 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1424  CRISPR-associated protein Cas2  40.91 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.183922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  36.26 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  38.82 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2839  CRISPR-associated protein Cas2  36.25 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1288  CRISPR-associated protein Cas2  39.77 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.566019  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  38.37 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  40.54 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.71 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  36.23 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  39.06 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.58 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  35.21 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  33.75 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  39.71 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  36.23 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  34.18 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  34.72 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  37.68 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  36.84 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  37.68 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  37.68 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  37.68 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.65 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.68 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  35.21 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  39.44 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  34.15 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  35.62 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.89 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  35.48 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.86 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  30.43 
 
 		 99 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>